对于想要妊娠或者正在孕期的患者，应该考虑单一的认知行为治疗，在妊娠决定开始或者是终止精神药物治疗，需要做完全信息的风险收益评估。
当胎儿婴儿或者是母亲发生危险的时候，需要评估药物治疗是否要开始或者是终止，因为母亲的健康将影响妊娠育后和产后婴儿的开户，这种情况下有人提出整合和权衡决定模式，由于这个强迫障碍患者常常十分焦虑，感到怀疑和因为要求完美或者是需要确定而痛苦。因此，帮助患者及其亲属达成知情决定，可能需要几次的会谈，记录提供的信息和临床合理选择治疗的方法是可取的。
已经妊娠的强迫障碍妇女当中，有13%-39%出现强迫障碍症状，妊娠前存在的强迫障碍患者。严重程度不受妊娠的影响，但也有报告强迫障碍患者的妊娠期症状有8%-17%恶化，14%的改善，有关整个妊娠期，使用三环类抗抑郁和选择性五羟色胺在摄取抑制剂的药物的长期影响治疗还是有限的，而且治疗也有一些相互矛盾的地方，所以需要医生和患者亲属一起商议和应对，妊娠头3个月暴露于药物。
新生儿可能会出现新生儿行为综合症，包括中枢神经系统、运动、呼吸以及胃肠道症状，虽然要保证监测暴露于药物的新生儿，但行为综合征通常是轻度的，并且可以使用支持性照料而得到控制，一般在出生后2周以内消失。
