菌阴性肺结核首先需要与肺炎相鉴别,肺炎的患者通常具有咳嗽、咳脓性痰,伴有畏寒发热、胸痛、胸闷等不适。行血常规检查白细胞多明显升高,肺部影像学检查多见到明显的炎性病灶浸润,有时可以伴有肺空洞坏死形成,患者多需要行痰培养相以鉴别。
另外就要于支气管扩张相鉴别,支气管扩张的患者容易反复发生咳嗽、咳痰以及咯血等症状,对于此类患者行胸部影像学检查可以见到特征性的支扩改变。
还要与支气管肺癌的鉴别,支气管肺癌的患者多是以咳嗽、咳血、胸痛、消瘦、低热等临床症状,患者行胸部影像学检查可见到典型的占位性病变,患者行支气管镜的检查或相应的病理活检可以得到确诊的目的。