人体对于植入的不是自己的东西，包括组织器官的抵抗反应称为排异反应，对于移植进来他人的肾脏也不例外。肾脏的排异反应分为超急性排异，加速性排异，急性排异和慢性排异四种类型。临床上以急性排异和慢性排异最为多见，也是移植肾丧失功能的主要原因。
急性排异都发生在移植手术后三天到三个月之内，但也可以发生于手术后的十年之内的任何时间，应该随时予以警惕。急性排异典型的临床表现为发热，尿量逐渐减少，肾移植逐渐的胀痛，肿大有压痛，血压由原来已经正常变为升高，肾功能明显下降或者原来已经恢复正常的血肌酐又重新升高，尿中出现红细胞以及尿蛋白等等。
近年来随着免疫抑制剂的应用，急性排异表现已经不典型，诊断有时并不容易。需要依靠各种检验技术，包括肾活检和医生的综合分析来判断。一经诊断必须要马上使用大剂量的甲泼尼龙冲击治疗或者是使用其他的免疫抑制剂，如抗T淋巴细胞球蛋白等等，移植肾功能可望恢复。慢性的排异反应可在，然后便开始发烧，但一般过程比较缓慢，虽然渐进加重其过程与肾炎的发病十分相似，表现为尿液的改变包括蛋白尿，血尿的血压升高，贫血逐渐的明显，血肌酐逐渐的升高，这种慢性排异过程基本上是难以逆转的，事实许多移植肾丧失功能的重要原因。
