对于新生儿先天性巨结肠来说,如果孩子在出生以后出现明显的腹胀,而且有感染迹象或者孩子的一般情况比较差,体重低,这时就不能考虑一期进行巨结肠根治术,而是需要首先开腹进行肠造瘘以及肠道活检手术。肠造瘘的目的是使孩子能够正常排便,减轻腹胀,这种手术创伤比较小,对孩子来说最为安全。
但是,在后期需要进行第2次手术,也就是进行巨结肠根治术以及肠造瘘还纳术。而对于一般情况比较良好,腹胀经过洗肠处理可以得到缓解的新生儿来说,手术可以在孩子新生儿期进行,大致在孩子20天左右进行一期巨结肠根治术,手术可以经肛门进行,对于病变肠管比较长的孩子需要联合经腹进行,经腹手术也可以选择微创腹腔镜或者经脐小切口进行手术。