高血压肾病的鉴别最重要的是与肾病引起的高血压进行鉴别，这两者到底是谁先引起的谁，这个鉴别也很重要，因为可能涉及到治疗方案的不同。
高血压肾病的往往患者年龄比较大，四十到六十岁左右，而且高血压在先，一般来说先有高血压十年左右的时间。而肾炎引起的继发高血压，患者的年龄可能偏轻一些，比如二十到三十岁的人容易出现这样的问题，而且先有肾炎，肾炎在先，之后才发现有高血压。
患者尿液中的检查也是不一样的，高血压肾病的患者尿蛋白定量一般不超过两克。而肾炎的病人引起高血压，这种情况它是肾炎为主，蛋白尿可能可多可少，如果20小时尿蛋白定量超过三克以上，那基本上可以认为是肾炎引起的高血压。
贫血的程度不一样，高血压肾病的患者发生贫血的时间比较晚，而且比较轻。但是如果是肾炎在先，引起高血压的患者，贫血发生的早，而且重。
另外，还有肾脏以外的一些其他的器官的损害并发症，高血压肾病的患者是高血压引起小动脉硬化它损害到肾脏，它同样也会伤害到其他的一些靶器官，比如说出现视网膜的问题，出现左心室肥厚，出现冠心病，脑动脉硬化等等。
但是如果是肾炎在先，继发了高血压，那这些其他的器官的损害就比较少见了。
如果还不能鉴别的话，那最终就是肾穿刺病理活检是能够完全鉴别诊断的，高血压肾病的患者肾脏的病理表现为良性的肾小动脉硬化，而肾炎的患者会有各种类型的肾小球的病变。
