运动神经元疾病的病因目前不清楚,认为是随着年龄的增长以后,由遗传因素以及环境因素共同作用的结果,所以说肯定是受遗传因素的影响,但是目前也没有证实,到底是哪一条染色体出现了问题,到底是属于什么性质的遗传也没有得到证实,但是目前已经发现了有十多种,跟运动神经元疾病相关的基因突变显然是基因遗传有一定关系的,如果是家族的一级亲属中有运动神经元疾病,后代患这种运动神经元疾病的概率就会增加,另外考虑跟环境因素有关系的。
目前根据大量的流行病学调查,发现了许多跟运动神经元疾病发病相关的环境因素,主要是包括重金属杀虫剂除草剂外伤饮食以及运动尤其是农业劳动、农村生活、电击伤、电离辐射等,都有可能会诱发运动神经元疾病,所以说目前得出来的结论是跟遗传有关系,但没有证实完全属于遗传性疾病。