急性感染后肾小球肾炎预后一般良好,不到0.5%的患者死于原发疾病,少于0.2%的患者死于或者是发展与终末期肾脏病,儿童预后较成人好,合并有急性肾衰竭和心液体肾小球肾炎的大于四十岁的患者预后更差,急性链球菌感染后的急进性肾小球肾炎预后要比其他原因引起的急性性肾小球肾炎预后好,需透析者经过短暂的透析后,多可逐渐恢复。
尽管肾功能还不能完全恢复到正常,在儿童约百分之二的儿童患者存在三到十年的蛋白尿,而成人约为15%,但这些异常最终都会消失,并且慢性肾衰竭的发生率低,合并有肾病综合症和持续大量蛋白尿的患者,预后差。
部分患者在急性肾小球肾炎急性发作数年后,发展为持续性高血压或者是终末期肾脏病,但导致进行性肾衰竭的原因是合并持续高血压的肾硬化症,还是进行性肾小球斑痕形成,目前尚不清楚。