目前认为膜增生性肾小球肾炎是免疫介导的肾小球肾炎,其发病主要与感染、免疫异常及遗传等因素有关。部分膜增生性肾小球肾炎的患者常有前驱感染病史,可导致免疫复合物在肾脏沉积并有补体介导引起肾脏损伤。
另外,有研究表明多数膜增生性肾小球肾炎患者,可出现低补体血症,提示旁路及经典途径均被激活,而导致血中补体的降低。
另外,部分患者血中存在补体激活物,也称之为致肾炎因子,致肾炎因子与转化酶结合可以加速c3的分解,导致血中c3水平的下降,沉积在基底膜上的免疫复合物也可以激活补体。补体旁路途径的激活又可以使c3肾炎因子继发性持续增加,而导致血中补体c3的下降。遗传因素在膜增生性肾小球肾炎的发病中也可能具有一定的作用。