正确的气管插管是灌洗成功的首要因素，需要仔细检查并确保双肺被完全分离，应该用支气管镜进行确认，这个非常重要，单侧的肺通气，则不通气的一侧肺应当没有呼吸音，开口处细线处无摆动进一步证明了无气流的存在，对侧的肺应行相应的检查，确保两肺分割良好。
一般而言灌洗首先选择病变严重的一侧肺进行，灌洗前需要先单肺的通气，先用百分之百的纯氧通气至少二十分钟，将治疗的肺在吸气膜隔离起来，在灌洗侧气管插管口接一个三通接头，分别连接预热的生理盐水和负压吸引器，开启振荡器，排出灌洗侧肺内的气体后，可注入温的生理盐水，每次灌入约五百到一千毫升左右。
一般根据生理盐水瓶的高度位置调节灌注压力，一般为30厘米左右，每次灌洗后用振荡器振荡以利于沉积的蛋白物质溶解并排出，随后需要开启负压吸引器尽量的排出。
每次灌洗后后应该以支气管镜吸完残余的液体，并检查气管插管的位置是否移位，每次灌洗后回收液体量的丢失不应超过150到两百毫升，应该仔细记录每次出量，如果丢失的过多或者大于两百毫升，应该警惕液体流入另一侧肺，必要的时候可给予适当的利尿，如血流动力学及血氧饱和度的稳定，可持续灌洗直至灌洗液有牛奶样浑浊的液体逐渐变为清尿为止。
