直乙状结肠炎的治疗要先区分直乙状结肠炎是溃疡性的还是感染性的，溃疡性直乙状结肠炎应诱导并维持临床缓解及黏膜愈合，防治并发症，改善病人生存质量。
一般治疗：
无论是溃疡性的还是感染性的直乙状结肠炎，都应纠正水电解质、酸碱平衡紊乱，特别是注意补钾。便血多、血红蛋白过低者适当输红细胞。病情严重者暂禁食，予胃肠外营养。注意禁用止泻剂、抗胆碱能药物、阿片制剂、非甾体类消炎药等以避免诱发结肠扩张。对中毒症状明显者可考虑静脉用广谱抗生素。
药物治疗：
溃疡性直乙状结肠炎患者用药建议：柳氮磺吡啶片：该药属口服不易吸收的磺胺类抗菌药，口服后在肠微生物作用下分解为5-氨基水杨酸和磺胺吡啶。前者发挥抗炎作用，后者对肠道菌群显示微弱的抗菌作用。美沙拉秦肠溶片：该药能直接作用于肠道炎症黏膜，抑制前列腺素及炎症介质白三烯的合成产生显著的抗炎作用，对发炎的肠壁结缔组织效果尤佳。口服后在结肠中释放转化为乙酰水杨酸，一部分被肠道内细菌分解,从粪便排出，另一部分由肠黏膜吸收。
感染性直乙状结肠炎患者用药建议：左氧氟沙星片：具有广谱抗菌作用，抗菌作用强，对多数肠杆菌科细菌敏感。孕妇、儿童、哺乳期妇女慎用。环丙沙星片：为合成的第三代喹诺酮类抗菌药物，具广谱抗菌活性，杀菌效果好，几乎对所有细菌的抗菌活性，但孕妇、儿童、哺乳期妇女慎用。
