子宫内膜异位症需与盆腔的炎症包块相鉴别。盆腔炎症包块多有急性盆腔炎感染病史和反复感染发作史。平时也可有下腹部隐痛,疼痛没有周期性,可伴发热和白细胞增高等等。
另外还要与子宫腺肌病相鉴别,腺肌病的痛经症状与异位症相似,但腺肌病的痛经一般更严重,疼痛位置位于下腹正中。妇科检查可以发现子宫多均匀性增大,呈球形,质硬,常和子宫内膜异位症合并存在。
另外还应该和卵巢的恶性肿瘤相鉴别,恶性肿瘤的病情发展比较快,一般情况差,妇科检查除可以触及包块以外,多伴有腹水,子宫直肠陷窝可以触及结节,较粗大,无触痛。B超提示一般肿瘤是囊实性或实性包块,CA125的值明显增高。