汗管瘤需要与毛发上皮瘤和扁平疣相鉴别。
毛发上皮瘤是向毛发结构分化的良性肿瘤,分化程度较基底细胞上皮瘤高。多发型为常染色体显性遗传,而单发型则无家族史。多发性毛发上皮瘤女性多见,常于幼年或青春期前发病,好发于面部,特别是鼻唇沟两侧,上唇周围和眼睑。皮损多发,直径3-10mm,呈半球形,质地坚实,皮肤色、黄色或淡红色。
扁平疣的皮损大多骤然出现,皮损为米粒至黄豆大扁平隆起的丘疹,表面光滑,质硬,淡褐色或正常肤色。圆形、椭圆形,数目比较多,零星分散或聚集成群。好发于颜面、手背等处。扁平疣是由于人类乳头瘤病毒感染所引起,具有传染性。