血清阴性脊柱关节病病因和发病机制目前尚不完全清楚,但大多数学者认为,本病的发生与遗传因素,某些环境因素,和免疫功能紊乱有一定的关系,本病通常有家族遗传倾向,与基因HLA-B27密切相关,通常会有家族聚集性,一些环境因素,比如某些细菌、病毒、支原体、衣原体等感染,也会诱发本病的发生。
尤其是在一些反应性关节炎、强直性脊柱炎中,会诱发疾病的发作或者加重,另外多种因素综合作用,会导致患者免疫功能异常,免疫紊乱,而促成本病的发生。
本病通常是多种因素综合作用的结果,大多数患者起病隐匿,但是只要早期诊断,早期进行合理有效的治疗,患者预后良好,而且本病不会影响到寿命。