脑栓塞最多见的栓子约75%的栓子栓塞与脑部,引起脑栓塞的常见的心脏疾病有心房颤动、心脏瓣膜病、感染性心内膜炎、心肌梗死、心肌病、心脏手术、先天性心脏病,来自体循环静脉系统的栓子经先天性心脏病,如房间隔缺损,卵圆孔未闭等异常通道,直接进入颅内动脉,而引起脑栓塞为反常栓塞,心脏黏膜瘤等。
少数病例利用现在检查手段和方法查不到栓子的来源,正常人血液呈流态,血液中的有形成分能通过变形,顺利通过微循环,如果血液内成分,如红细胞聚集形成轴线物,也容易阻塞血管,人体血液循环中,某些异物随血液流动,如来源于心脏的栓子。上述血凝块动脉粥样硬化,脱落的斑块、脂肪、细胞及气泡等称为栓子,栓子进入脑循环,绝大多数双子进入颈内动脉系统,因大脑中动脉实质上是颈内动脉的直接延伸。