第一,支气管肺泡灌洗术,可用于疾病的特异性的诊断,包括在巨细胞病毒性肺炎,患者可以发现巨细胞病毒包涵体,肺泡蛋白沉积症的患者经镜下可见泡沫样的巨噬细胞。肺泡出血综合症的患者可见含铁血黄素沉着的巨噬细胞,恶性肿瘤患者可见恶性肿瘤细胞,石棉沉着病的患者可见石棉小体,嗜酸性粒细胞肺疾病的患者,可见嗜酸性粒细胞比例大于25%。
第二,可用于疾病的辅助性诊断,在胸部的肿瘤患者,支气管肺泡灌洗可见巨噬细胞比例下降,淋巴细胞及中性细胞比例升高。
第三,弥漫性肺实质性疾病的辅助诊断,可见不同比例的淋巴细胞增加,中性粒细胞增加,以及嗜酸性粒细胞均增加。