口腔局部疾患是主要导致口臭的原因，但不容忽视的是口臭也常是某些严重系统性疾病的口腔表现，有一些器质性疾患，也会导致口臭症，分为病理性口臭和生理性口臭，病理性口臭分为口源性口臭和非口源性口臭。
据统计80%到90%的口臭是来源于口腔，口腔中有未治疗的龋齿、残根、残冠、不良修复体、不正常的解剖结构，牙龈炎、牙周炎及口腔粘膜病等都可以引起口臭，其中龋齿和牙周疾病是最常见的相关疾病。
而非口源性的口臭是口腔邻近组织疾病，如化脓性扁桃体炎、慢性上颌窦炎、萎缩性鼻炎等，可以产生脓性分泌物而发出臭味。临床上常见的内科疾病如急慢性的胃炎、消化性溃疡出现酸臭味，幽门梗阻、晚期胃癌常出现臭鸭蛋性的口臭。
生理性口臭是饥饿、使用了某些药物或者是洋葱、大蒜等刺激性食品，抽烟、睡眠、唾液分泌量减少所致的，细菌大量分解、食物残渣等都可能引起短暂的口臭。
而对于口臭的治疗，口臭并不可怕，只要查明原因是可以治疗的。首先考虑口臭是口源性还是非口源性的，对于不能排除与口臭相关的因素，如呼吸系统疾、消化系统疾病、实质脏器损害、或者是糖尿病性酮症和尿毒症、白血病、维生素缺乏等，则应该先对这些疾病进行局部或全身的系统治疗，之后口臭也会得到治愈。
