国际上认为年满十四岁,尚无月经来潮而第二性征不发育者,或年满十六岁,尚无月经来潮无论第二性征是否正常者均为原发性闭经,一般第二性征发育后两年来月经。
原发性闭经的病因分类,首先是内外生殖器解剖异常,包括处女膜闭锁、先天性无阴道、先天性无子宫。第二大类是内分泌异常,包括甲状腺功能减退,青春期的甲状腺功能减退使患者代谢缓慢、性腺轴成熟减慢、月经来潮延晚,早期的甲减可合并性腺发育不痊,预后不良。
还有高催乳激素血症,可伴有溢乳,有垂体巨腺瘤或微腺瘤或空蝶鞍症,或垂体分泌催乳激素细胞增生所致,引起低雌激素而闭经,青春期发病则原发闭经,其他的原因还有炎症,例如幼年的脑膜炎、脑炎后遗症等使下丘脑分泌受影响,还有损伤,例如在幼年期恶性卵巢瘤手术切除了子宫和附件,尤其是生殖细胞瘤,预后较好可以存活,但为无子宫无卵巢的原发闭经。