首先应该与贲门失迟缓症相鉴别。贲门失迟缓症又称贲门痉挛,它是指食管下括约肌松弛障碍,导致的食管功能性梗阻,在婴幼儿表现为喂养困难,呕吐,重症者可以伴有营养不良,生长发育迟缓,年长儿可以诉胸痛和烧灼感、反胃,通过x线钡餐造影,内镜以及食管侧压这些检查可以确诊。
对于以呕吐为主要表现在新生儿、小婴儿应该排除消化道器质性病变,比如,先天性肥厚性幽门狭窄、胃扭转、肠旋转不良,环状胰腺以及胎粪性腹膜炎等,对于反流性食管炎伴并发症的患儿,必须排除由于物理性、化学性、生物性等致病因素所引起组织损伤而出现的类似症状。