1、克罗恩病:
本病的临床表现、x线及内镜所见常和肠结核酷似,必须仔细鉴别。
2、右侧结肠癌:
本病比肠结核发病年龄大,常在40岁以上,一般没有发热、盗汗等结核毒血症表现,x线检查主要见钡剂充盈缺损,病变局限在结肠,结肠镜检查及活检可以确定结肠癌的诊断。
3、阿米巴病或血吸虫病性肉芽肿:
既往有相应的感染史,脓血便常见,结肠镜检查多有助于鉴别诊断,粪便常规或孵化检查发现有关病原体。
4、其他肠结核:
有时还应当与肠恶性淋巴瘤、耶尔森杆菌肠炎以及一些少见的感染性肠病来相鉴别,以发热为主要表现者,需要与伤寒等长期发热性疾病鉴别。