一,化脓性脑膜炎,其中最容易混淆者为嗜血流感杆菌脑膜炎,因其多见于两岁以下小儿脑脊液细胞数有时不高。其次为脑膜炎双球菌脑膜炎及肺炎双球菌脑膜炎,鉴别除了结核接触史,激素反映及肺部x线检查可助诊断外,最重要的还是脑脊液检查。
二,病毒性中枢神经系统感染,主要是病毒性脑炎、病毒性脑膜炎、病毒性脊髓炎均可与结脑混淆,其中散发的病毒脑炎比流行性者更需要加以鉴别。
三,新型隐球菌脑膜脑炎,其临床表现,慢性病程及脑脊液改变酷似结脑,但病程更长可自发缓解。
四,脑脓肿,脑脓肿患儿多有中耳炎和头部外伤史,有时继发于脓毒败血症,常伴先天性心脏病。
五,与脑瘤相鉴别。