念珠菌病的诊断可以通过真菌检查、病理诊断和眼底检查这几个方面来进行。因为念珠菌是常驻菌,从皮肤、黏膜、痰和粪便等标本中查到孢子不能肯定其为致病菌,只有在镜下见到出芽的酵母菌与假菌丝,结合相关临床表现才能确定念珠菌病的诊断。
病灶组织等标本,显微镜检查可见厚膜孢子以及假军菌丝,多次显微镜检查阳性有诊断意义。标本真菌培养一周内出现乳白色光滑菌落,并且落数大于50%,有诊断意义。
在病理组织中,发现真菌和相应的病理改变即可确诊。眼底检查是念珠菌菌血症患者,在视网膜和脉络膜上可见白色、云雾状或者棉球样的病灶。