肝结石可多年无症状或者仅有上腹以及胸背部胀痛不适,多数病人因体检或其他疾病做超声等影像学检查偶尔发现,肝内胆管结石常见的临床表现是急性胆管炎引起的寒战、高热以及腹痛,除合并肝外胆管结石或者双侧肝胆管结石以外,局限于某肝段肝叶的,可以无黄疸。
严重者出现急性梗阻性化脓性胆管炎,全身脓毒症或者感染性休克,反复的胆管炎可导致多发的肝脓肿,如形成较大的脓肿可以穿破膈肌和肺形成胆管支气管瘘,咳出胆渣样或者胆汁样的痰,长期梗阻甚至可以导致肝硬化表现为黄疸,腹水,门静脉高压以及上消化道出血,肝功能衰竭,如果疼痛为持续性,进行性消瘦,感染难以控制,腹部出现肿物或者腹部瘘管流出黏液状,应该考虑肝胆管癌的可能。