目前来说,肉芽肿性多血管炎病因尚不十分清楚,多数人认为与免疫反应异常有关,由于绝大多数患者先有上呼吸道症状,又有人发现用磺胺类药物治疗有效,推测其发病与微生物感染有一定关系,因此有人认为上呼吸道感染后,被分解的物质可能作为致敏原,导致机体产生异常变态反应而发生改变。
另外,有半数患者化验检查类风湿因子,以及抗平滑肌抗体阳性,病人具有高丙球蛋白血症,以及免疫复合物,毛细血管壁内有免疫球蛋白沉积,故认为该病可能是一种自身免疫性疾病,发病可能与免疫复合物有关,并有细胞免疫介入,有人发现组织损伤是由于血管内的白细胞裂解,进而引起血管内皮细胞破坏,以及血管阻塞,从而产生血管炎。