病原学诊断主要包括以下三个方面:
一、标本采集和结核菌的检测,标本主要来源于包括痰液、超声雾化导痰、下呼吸道采样、支气管冲洗液、支气管肺泡灌洗液、肺及支气管活检标本,涂片阴性不能排除肺结核,连续检查大于等于3次可以提高检出率,分离培养法灵敏度高于涂片电解法,可直接获得菌落,便于与非结核分枝杆菌鉴别,是结核病诊断的金标准,未进行抗结核治疗或者是停药48-72小时的肺结核患者可以获得比较高的分离率。
二、结核菌药物性、敏感性监测,对肺结核痰菌阴转后复阳,化学治疗3到6个月,痰菌仍持续阳性,治疗菌群减少后有持续增加,即复治患者应进行药物敏感性监测,原发耐药率较高地区有条件时,初治肺结核也可行药物敏感性监测。
三、血清抗结核抗体检测,血清学诊断可成为结核病的快速辅助诊断手段,但特异性强,敏感性较低。