如果怀疑食管癌要确诊的话，首选是胃镜检查，通过做胃镜，不但能够确定有没有食管癌，还可以确定食管癌是长在食管的哪一个部分，是在靠进口侧端，还是靠近胃那一端，甚至可以精确地定到多少公分，食管癌长的形状、多大、有多深，可以对于食管癌做很精确的诊断，立体的诊断。
同时做胃镜的时候，还可以取一块食管癌的组织，然后去在显微镜下观察，做病理的诊断。这样病理可以判断出，他到底是食管的鳞状细胞癌，还是腺癌，还是鳞腺癌，还是其他的少见的肿瘤，比如类癌等等，都是能够做精确的诊断。除了做胃镜的检查诊断食管癌以外，还可以做钡餐。做钡餐在吞钡的时候，可以看到食管有一些，比如充盈的缺损，或者蠕动得不好，或者是有钡剂的反流等等，这些情况都能够帮助我们去诊断食管癌，但是它不像胃镜，那么敏感和精确。
如果食管癌怀疑他已经到了进展期，出现了脏器转移的时候，还要做一些像胸腔的CT，或者是腹腔的核磁。这些检查看看他有没有发生向淋巴结的转移，向肺转移，或者向肝转移，这些脏器的转移，来帮助我们确定食管癌的分期。根据分期和组织学的分型，好选择对病人的最佳治疗。
如果经过治疗以后的病人，进行随访的时候，看要监测食管癌是不是有可能复发。这种情况，可以定期地做血的肿瘤标志物。如果在手术之前，指标是高，做了治疗以后指标降到正常。如果治疗之后，在随访的过程中，再次升高，一定要警惕是不是有肿瘤复发的可能性。所以在做食管癌的诊断的时候，胃镜是首选的，消化道造影、CT、核磁、超声，还有血液化验都是辅助的诊断手段。
