颅脑磁共振检查对闭塞性脑血管病的检出率高,而且发现时间早。当颅脑ct扫描在发病后24小时呈现阴性的时候,颅脑磁共振检查已能清楚地显示出病灶,最早发病6小时即可以显示出来。另外ct扫描对颅脑20毫米以下的小软化灶显示不清,而颅脑磁共振检查则可以描记出小到直径8到15毫米的腔隙性脑梗死.
另外ct扫描对于脑干,小脑以及颅底等部的病灶,由于易受颅骨干扰而容易出现伪影。磁共振检查则没有此项缺陷,CT扫描和磁共振检查对脑出血确认率均为百分之百。但是对于血管畸形,动脉瘤诊断,脑ct检查,需要注射对比剂才能显示,而颅脑磁共振检查不仅能清楚的证明畸形血管出血,还能对隐形的动静脉畸形做出判断,这无疑给禁忌使用对比剂的患者带来方便。