军团菌病的患病率因地区的不同而有所不同,在夏末秋初为高发季节,在社区吸烟者,嗜酒者,建筑工地的民工以及旅游者容易感染,在医院内,在血液透析,器官移植,恶性肿瘤接受免疫抑制剂治疗以及免疫功能低下的慢性阻塞性肺疾病患者都很容易发生军团菌感染。
主要通过吸入含有军团菌的气溶胶而感染,气溶胶主要来自于空调系统,暖水管道,供水系统以及旅馆等,主要感染的病原菌是军团杆菌,它广泛存在,土壤和水中,抵抗力很强至少可以存活一年以上,在自来水中可以存活一年左右,在蒸馏水中也能生存一百天左右。在人工管道系统中,例如冷却塔,水龙头,淋浴的喷头中也很容易滋生军团菌,空调系统的带菌是造成军团菌病暴发流行的主要原因。