肠道的优势菌群是专性厌氧菌可以定植在肠道黏膜表面的深部,宿主健康有利的细菌低免疫原性,比如有些拟杆菌或者是双歧杆菌,乳酸杆菌等等。

再就是包括一些共生菌是肠道的非优势菌群和原籍菌有共生的关系,一般是没有传染性的,比如消化链球菌等等。

在外来的细菌病原菌就是在肠腔表面可以游动,比如大肠埃希菌或者是肠球菌,长期定植的机会一般来说是比较少的,多数肠道菌群可以分为革兰氏阳性的菌群,放线菌群革兰氏阴性杆菌等等。

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