肠结核好发于回盲部,依次为升结肠、空肠、横结肠、降结肠、阑尾、十二指肠及乙状结肠等处。偶尔也有位于直肠者。胃结核也有报道,但很少见。
结核菌侵入肠道后,其病理变化随人体对结核杆菌的免疫力和过敏反应的情况而定。当感染的菌量多、毒力大机体过敏反应强时病变往往以渗出为主。并且可有干酪样坏死,形成溃疡,称为溃疡型肠结核。
如果感染较轻机体免疫力主要是细胞免疫力较强时,病变常为增生型,以肉芽组织增生为主,形成结核结节并进一步纤维化,称为增生型肠结核。实际上兼有溃疡和增生两种病变者也并不罕见,称为混合型或溃疡增生型肠结核。