常规检查有:血常规,尿常规,生化全项,CRP,血培养等。专项检查有:心肌酶,肌钙蛋白I,肌钙蛋白T,心衰标志物BNP,心电图,心脏超声等。以上这些检查或检验项目是所有怀疑本病的患儿都需要做的,也是所有具有收治本病能力的医院都必须具备的。
还有一些比较特殊的检查,这些检查一般需要做的病人不多或是大多数医院都不具备条件来做。比如病毒学检测,检测标本中病原的抗体滴度或是DNA来明确病原,这项检查对心肌炎的诊断是很有用的,但是很多医院不具备检测条件。心脏MRA即心脏血管造影,用来观察心肌的血液供应和心脏大血管的结构,主要用于心脏严重受损的患者,对于心肌炎而言使用该检查的病人较少。心肌活体组织检查,目前认为是心肌炎诊断的金标准,由于取材难度大,临床上使用受限,多用于死后尸检。