目前认为和基因遗传有一定的关系。所谓的基因遗传是指患有该病的患者大多数携带HLA-B27这类基因,尤其是与B2704、B2705和B2702呈正相关。
除了这些易感基因以外,强直性脊柱炎患者发病一般是与病原体感染有关,主要是泌尿生殖道沙眼衣原体,志贺菌或者是沙门菌等特殊病原体感染。这些感染激发了人体的炎症应答和免疫应答,从而造成了组织损伤,而导致强直性脊柱炎发病,但是里面的具体发病机制现在还不是非常清楚。
强直性脊柱炎是一种慢性自身炎症性疾病,多数患者预后良好,少数患者可以发生严重的脊柱畸形和关节强直。