对于急性骨髓炎,它的并发症主要是局部的红肿热痛以及患肢的功能障碍,一般情况下不会出现严重的并发症。但是对于慢性骨髓炎,会产生比较严重的并发症,首先有可能会导致肢体的畸形,由于骨骺受到炎症的刺激,患肢过度生长,所以变得比较长,或者骨骺板受到了破坏,影响了局部的发育,结果患肢短缩,骨骺板一侧受到破坏,发育不对称,那么使关节出现内翻或者外翻的畸形,由于局部软组织的瘢痕以及挛缩,也可以引起屈曲畸形。
另外有可能会导致关节的强直,由于感染扩散到了关节内,关节软骨面受到破坏,使关节呈现纤维性增生,所以有的时候会出现骨性强直。另外还有可能会导致癌变,窦道口的皮肤由于不断的受到刺激,可以发生癌变。