新生儿黄疸主要的并发症有胆红素脑病、败血症、新生儿肺炎等。胆红素脑病为新生儿黄疸最严重的并发症,多发生在生后一周内。主要是由于非结合胆红素水平过高,透过血脑屏障,造成中枢神经系统功能障碍。如不经治疗干预可造成永久性损害,出现胆红素脑病后遗症表现可有眼球运动障碍、听觉障碍等。
胆红素常造成基底神经节、海马、下丘脑神经核和小脑神经元坏死。尸体解剖可见相应的神经核黄染,故又称核黄疸。根据引起黄疸的具体原因,结合光照疗法、换血疗法、药物疗法、支持疗法等及时把胆红素值降下来,预防胆红素脑病的发生,避免留有后遗症。