女性小腹疼的原因有很多,可能为阴道发育异常,比如阴道闭锁,完全性横隔,子宫发育异常,比如残角子宫,卵巢子宫内膜异位囊肿等所引起的。阴道发育异常比如阴道闭锁,绝大多数患者至青春期因经血排出不畅,发生周期性下腹坠痛呈进行性加剧,严重者可引起肛门或阴道部胀痛或尿频等症状。完全性横膈也是因为经血排出不畅,有原发性闭经伴周期性腹痛并呈进行性加剧的特点。
子宫发育异常,比如残角子宫,若子宫内膜有功能但其宫腔与单角宫腔不相通者,往往因月经血倒流或宫腔积血出现痛经,也可发生子宫内膜异位症,从而引起下腹部疼痛。卵巢子宫内膜异位囊肿经常会由于经期囊内出血,压力增加,而多次出现小的破裂,由于破裂后立即被周围组织粘连,而仅造成一过性的下腹部或盆腔深部疼痛。