病毒性肠炎见于犬瘟热病毒,犬细小病毒,犬猫冠状病毒引起的肠炎,在病毒性肠炎中轮状病毒是婴幼儿腹泻的主要病因,而诺瓦克病毒是成人和大龄儿童流行性病毒炎的主要病因。
细菌性肠炎,细菌性肠炎见于大肠杆菌、沙门菌细菌和耶尔细菌、毛样产芽胞杆菌、空肠弯曲杆菌引起的肠炎。细菌性肠炎的致病因与痢疾杆菌最常见,其次为空肠弯曲菌和沙门菌。真菌性肠炎见于胞浆菌、藻状菌、曲霉菌、白念珠菌引起的肠,真菌性肠炎以白色念珠菌最为常见。寄生虫引起的肠炎有球虫、蛔虫、钩形虫等引起的肠炎。寄生虫引起的肠炎以溶组织内阿米巴较为常见。