早上醒来咳嗽主要是由于机体受凉、淋雨、熬夜、疲劳等诱因使病毒、细菌、支原体、衣原体、立克次体等病原体入侵到体内。另外也可能接触一些可疑的致敏源,比如花粉、灰尘、油烟、二氧化硫、氯气以及尘螨等刺激到呼吸道,而使呼吸道粘膜出现了充血、水肿、大量炎性物质渗出的炎症改变。
而夜间人体的交感神经相对兴奋,容易使呼吸道粘膜渗出更多的分泌物,这个时候一晚上的分泌物积聚在呼吸道、支气管、咽喉部位,早晨醒来的时候这些大量的分泌物会刺激咽喉部,引起反射性的咳嗽。所以早晨起来会咳嗽非常明显。临床上最常见的是急性支气管炎、慢性支气管炎急性发作、咳嗽变异性哮喘、肺部感染等。