遗传因素占一重要的部分,一般认为,牙颌面的畸形具有特殊性的传递规律,也就是遗传性疾病。还有就是环境的因素,和出生以后的环境有重要的关系。有些的胚胎在发育过程中受到某些攻击力的刺激因素如感染,外伤,内分泌等因素的作用可以导致颌面畸形。
另外,一般把遗传因素和出生前的环境因素,这些称为先天性的因素,是口腔颌面最常见的一种先天性的畸形,出生后的环境因素在牙颌面畸形形成中作用也比较重要,后天环境的因素主要指神经肌肉适应性的功能变化对于颌面生长发育的影响,如单侧咀嚼导致单侧颌骨发育不足,这些都是严重的影响颌面畸形的原因。