肾结核绝大多数都是由其它部位的结核感染导致,主要通过血行播散。肾结核绝大多数都是肺结核,也可能是骨关节结核或者是消化道结核,当这些部位的结核通过血进入肾脏皮质,早期都是在肾皮质肾小球周围进行小的病灶,这里的血液循环很丰富,患者的免疫功能强,一部分就可以有效的治愈,如果免疫功能差结核的毒力强。结核菌数量多,这种情况可能就会逐步进展。
当由肾皮质进入肾小管袢处,这里就容易导致结核逐步加重,因为这里的血液循环差,容易导致结核菌素进一步的繁殖增多,病情逐步进展可能会穿破肾乳头进入肾盏肾盂,就是典型的肾结核,溃破后通过尿液进入输尿管、膀胱也可能蔓延到输尿管结核、膀胱结核以及睾丸、附睾结核等。