奥硝唑和常用的甲硝唑都属于同一类药物，属于硝基咪唑类的抗厌氧菌的药物。
在使用过程中的副作用，可能会有一些轻度的胃肠道的反应，比如会引起恶心或者是呕吐。此外会有一些中枢神经系统的症状，比如会有嗜睡或者是头痛。少数患者可能会有一些中枢神经系统的障碍，比如会有震颤或者会引发癫痫的发作，能出现疲劳眩晕等。另外，在服用药物期间会引起味觉障碍，而且对肝功能还会造成一定的损伤，会引起转氨酶或者是黄疸的升高。此外可能会出现一些过敏的反应，比如会出现皮疹或者是瘙痒。所以在使用奥硝唑的时候，如果是对于药物过敏或者是对于其他的硝基咪唑类的药物过敏的话就要禁止使用奥硝唑的。
另外奥硝唑是属于第三代的硝基咪唑类的常用的抗生素。所以在临床中主要是可以用于一些厌氧菌或者是一些其他的阿米巴原虫等引起的感染。比如可以用于毛滴虫引起的泌尿系的感染或者是可以用于阿米巴原虫引起的阿米巴虫病，还可以用以其他的厌氧菌的感染，比如可以用于厌氧菌引起的败血症或者是脑膜炎、腹膜炎等。
在使用药物的时候，要注意如果是有中枢神经系统疾病的患者，比如有癫痫的患者的话，是要谨慎使用的，此外，如果有肝功能不全的患者或者是妊娠患者，哺乳期妇女的话都要谨慎使用药物。
