卵巢囊肿分为生理性的囊肿和病理性的囊肿，生理性的囊肿大多是卵巢的黄体囊肿，在卵巢的黄体期卵巢是囊性增大的，一般的情况下经过观察两到三个月以，后卵巢的黄体囊肿能够自行的消退。如果彩超检查提示卵巢的就是囊肿囊性增大，处于卵巢的黄体期，考虑生理性囊肿是不能排除的。
如果查肿瘤标志物是正常的，而且没有明显的腹痛、不适等症状，可以动态观察，观察三个月以后在月经干净以后，再到医院复查盆腔彩超。如果彩超的检查提示囊肿消退，考虑是生理性囊肿。如果彩超检查提示囊肿持续存在，说明是病理性的囊肿。
对于病理性的囊肿，我们常规要做手术治疗，如果根据术前的症状、体征、妇科检查、辅助检查的情况，考虑是卵巢囊肿的良性的可能性比较大，可以进行微创手术。微创手术目前首先腹腔镜手术，腹腔镜手术具体的手术范围根据患者的年龄、有没有生育要求，以及有没有其他的症状来决定。
如果对于年轻女性，卵巢脓肿我们一般行卵巢囊肿的剥除术，术中根据术中的病理结果决定是不是扩大手术范围。对于没有生育要求的或者是已经绝经的，可以行外侧的附件切除或者是双侧的附件切除，或者是全子宫以及双侧附件的切除术，术中再根据术中的冰冻决定是否扩大手术范围。
如果术中的冰冻提示是恶性的，要行经腹的手术。如果出现诊断考虑卵巢囊肿恶性的可能性比较大，要行经腹手术，经腹手术根据术中的探查情况，确定是行卵巢恶性肿瘤的分期手术，还是行卵巢恶性肿瘤的减灭术。
