引起结肠炎的原因有很多种，比如一些自身免疫反应，感染、遗传，还有一些神经因素等等，那么多数的学者认为本病它属于自身免疫性疾病，因为本病并发自身免疫病较多，肾上腺的皮质激素能够使病情缓解，在部分患者的血清中也是可以查到抗结肠上皮细胞的抗体，所以认为本病的发生可能会与自身免疫反应有关。
感染因素本病的病理变化和临床表现，与一些结肠感染性疾病相似，因而有些人认为感染是本病的病因，在细菌、真菌和病毒等多种因素中，目前的研究表明病毒的可能性会比较大一些。
遗传因素，本病的血缘家庭发病率较高，根据国外文献统计，溃疡性结肠炎的病人，他的直系血缘亲属中，约有15%到30%的人发病，此外双胞胎的研究表明，单核子比双核子更加的容易发病，也就是说本病的发生，它还会可能与一些遗传的因素有关，有人认为精神因素在发病中起一定作用，患者多有某些的性格特征。
对于生活中的重大事件的心理承受能力和适应性差，它属于心身疾病的一类，心身疾病强调心理因素在疾病的发生或者是病程中起重要作用，有人也是将几种疾病列为身心疾病，比如哮喘、类风湿性关节炎、溃疡性结肠炎、原发现高血压、神经性皮炎、甲状腺功能亢进和十二指肠溃疡等等。
目前，可能有更多疾病被列为身心疾病，那么结肠炎的患者，一定要注意，保持良好的情绪，要避免感染，在饮食上也要注意饮食的卫生。
