阴茎背神经阻断术除了可能有常见的感染、出血、切口裂开等并发症以外。阴茎背神经阻断术,如果切断的阴茎背神经分支过多,则容易导致并发症增加,如阴茎麻木、勃起功能障碍。一般情况下,阴茎背神经部分分支切断并不影响勃起功能,但可能造成阴茎麻木、感觉明显缺乏,会使阴茎反射性勃起功能减退,影响到阴茎勃起功能。
因为老年男性本身易患ED,所以该手术不适于老年人或合并ED的早泄患者,国内外都有通过阴茎背神经阻断术,治疗早泄的报道,可能有一定的疗效,但是安全性以及长期效果,仍有待于进一步的研究。由于射精反射的生理过程复杂,目前对其相关的基础研究较少,很多环节的详细机理还不清楚。