因志贺菌对抗生素耐药性的逐年增长,并且多呈多重耐药性的趋势,故拉痢疾需要根据当地流行菌组的药敏试验,或者是患者大便培养的药敏结果选择敏感的抗生素进行治疗。常用的口服药物有喹诺酮类,诺氟沙星,氧氟沙星,环丙沙星等,还可选用复方磺胺甲恶唑以及头孢克肟等抗生素治疗。中药方面可以选择黄连素,但需要注意喹诺酮类药和复方磺胺甲恶唑耐药性的增加以及其副作用。
儿童和小于十八岁的青少年,不宜采用喹诺酮类药物,以免影响骨骼生长、发育,导致骨骼畸形等。有肝病、肾病、磺胺过敏和白细胞减少症者,忌用复方磺胺甲恶唑。拉痢疾的患者多有脱水,为了保持水,电解质酸碱平衡,无论有无脱水表现的患者均应口服补液盐治疗,当患者出现痉挛性腹痛时可以给予颠茄片进行止痛、解痉,当患者发热时,以物理降温为主,如有高热可以给予退热药物治疗如芬必得等。