在发展中国家,下呼吸道感染通常为主要的死亡原因,仅次于腹泻,三十岁以上成人肺炎的最常见病因是细菌,其中肺炎链球菌最常见。其他病原菌包括厌氧菌、金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌、肺炎衣原体、鹦鹉热衣原体、沙眼衣原体,卡拉莫拉菌,嗜肺军团菌,肺炎杆菌和其他革兰氏阴性杆菌。肺炎支原体为一种,类似细菌的微生物,是年龄较大儿童和青年特别常见的病因,常见于春季。
婴儿和儿童主要肺炎病原体是病毒,呼吸道合胞病毒,腺病毒,副流感病毒,甲型和乙型流感病毒,这些病原体也能引起成人肺炎。
但对健康的成人来说,唯一可能严重且普遍的病毒是甲型流感病毒,偶尔还有水痘,带状疱疹病毒。其它病原体有:更高级的细菌,包括诺卡菌和放线菌。分枝杆菌包括结核分枝杆菌和非典型菌株,主要为堪萨斯分枝杆菌和鸟型细胞内分枝杆菌。