霉菌阴道炎的病因首先它是由假丝酵母菌引起的常见外阴阴道炎症。
国外资料显示75%的妇女一生中至少患过一次外阴阴道假丝酵母菌病。45%妇女经历过两次或者两次以上的发作，80%到90%个病原体是白假丝孝母菌，10%到20%为光滑假丝孝母菌、近平滑假丝酵母菌、热带假丝酵母菌等等。
酸性环境适宜假丝酵母菌生长，有假丝酵母菌感染的阴道ph值多在4.0%到4.7%，通常小于4.5。白假丝酵母菌为双相菌，有酵母相和菌丝相。酵母菌为芽生孢子，在无菌无症状寄居及传播中起作用。菌丝相为芽生孢子生长呈假菌丝，侵袭组织能力加强。
假丝酵母菌对热的抵抗力不强。加热至60度1小时即死亡。但是对干燥、日光、紫外线及化学制剂等抵抗力较强。
白假丝酵母菌为条件致病菌，有10%到20%妇女，非孕妇女在百分之十及30%孕妇阴道中有此菌寄生，但是量极少并不引起症状。只有在全身及阴道局部免疫力下降，假丝酵母菌大量繁殖并转为菌丝相才出现症状。
常见病因有长期使用广谱抗生素、妊娠糖尿病、大量应免抑制剂、长期应用抗生素抑制乳杆菌生长，有利于假丝酵母菌繁殖，妊娠期糖尿病时机体免疫力下降，阴道组组织内糖原增加，酸度增高，有利于假丝酵母菌生长。
大量应用免疫抑制剂，如皮质类固醇激素或者免疫缺陷综合症，机体抵抗力降低。
其他诱因比如说胃肠道假丝菌、应用含高剂量雌激素的避孕药，穿紧身化纤内裤及肥胖，后者就因会因局部温度增加酵母菌易于繁殖而引起感染。
