病理性尿痛的原因很多,但主要是膀胱和尿道疾病。膀胱尿道受刺激最常见的是炎症性刺激,如肾盂肾炎、肾结石合并感染、肾结核、膀胱炎、尿道炎、前列腺炎、阴道炎等,在急性炎症和泌尿系活动相结合时最为明显。炎性刺激和结石肿瘤、膀胱和尿道内异物、膀胱瘘和妊娠压迫等,膀胱容量减少,如膀胱占位性病变和膀胱壁炎症浸润硬化,所致膀胱容量减少。
膀胱神经功能失调,常见于精神紧张,可伴有尿急但无尿痛。其他女性尿痛最常见原因是尿路感染,包括肾盂肾炎、膀胱炎和尿道炎。另外阴道炎、老年萎缩性阴道炎,膀胱收缩和括约肌松弛以及膀胱肿瘤等都可造成尿痛,男性尿痛可有前列腺炎,尿路感染。