因为能引起腹泻的病原菌有很多,要想确诊必须找到病原,大便镜检可以见多数红细胞和少量的白细胞,血液部分容易找到阿米巴滋养体,慢性者应同时查包囊,要想得到病原,粪便标本必须新鲜无尿液混杂,保温保湿,采取病人刚排出的粪便,在室温下必须在三十分钟内检查,因为滋养体离开人体后很快会死亡。
另外乙状结肠镜检查也可以帮助诊断,在慢性阿米巴痢疾时,症状明显时,每日三到五次,大便稀便可有黏液,在粪检中可以找到阿米巴滋养体,没有明显腹泻时,粪便中可以找到阿米巴包囊,在明显的急性发作时可以排出果酱样的大便,有的可以伴有贫血,以上就是诊断阿米巴痢疾的一些依据。