一般肠炎多数由病毒或者非侵袭性细菌所致,一般不用抗生素。
如果是伴有明显中毒症状,不能用脱水解释者,尤其是对重症患儿、新生儿、小婴儿和衰竭婴儿应选用抗生素治疗。而出现黏液脓血便的患者,多数是由侵袭性细菌感染引起的,应该根据临床特点,针对病原,经验性选用抗菌药物。然后,再根据大便细菌培养和药物敏感实验结果进行调整。
大肠埃希菌、空肠弯曲菌、耶尔真菌属伤寒沙门菌所导致的感染,常选用抗革兰阴性杆菌的以及大环内酯类抗生素,常用的有头孢菌素等等。
而对金黄色葡萄球菌肠炎、假膜性肠炎、真菌性肠炎应该立即停用原来使用的抗生素,根据症状选用苯咗西林钠、万古霉素、利福平、甲硝唑或者抗真菌药物。