孤独症的原因目前来说并不是十分清楚。
第一,和遗传因素有关,孤独症同胞患病率大约在2%到3%,高于一般人群。
第二,脑功能障碍,脑功能障碍可以引起认知语言和非语言的交流困难,出现感觉统合失调,对外界刺激不能做出相应的反应,可能和先天发育异常,出生缺陷、围生期脑缺损有密切的关系。
第三,和心理因素有关,孤独症可能和父母的教育不当有关系,父母,对孩子的冷漠放任不管是造成孤独症的一个因素,但后来也有证明父母照料和孤独症发生没有任何关系。
第四,神经病理因素,事件发现孤独治病人颞中回有局限性的病变,30%到75的孤独症病儿,动作显得比较笨拙,肌张力改变,步态异常,震颤等等。
第五,通过影像学的研究发现,孤独症病人,有脑室的扩大,脑的损伤,脑干的缩小等等一些改变。