病毒性心肌炎80%能够痊愈，5%至20%可以遗留心脏扩大以及心电图异常，而致慢性心肌炎或者是后遗症，小于5%患者因急性心衰，严重心律失常或者是心源性休克而死亡，病毒性心肌炎的病理改变以及临床表现差异很大，因此其转归和预后也很不一致，病毒性心肌炎预后大者可以分为以下几类：
一、重型或者是爆发型病毒性心肌炎，患者疾病急，病势凶猛，往往一个月内会出现充血性心力衰竭，心源性休克，持续恶性室性心律失常发作，阿斯综合征，急性心包炎或者是急性肾功能衰竭的表现，也可以引起猝死或者是因抢救无效而死亡。
二、轻或者是中型病毒性心肌炎，这类患者预后良好，虽然急性期可以有明显的临床表现，但是经治疗后，一般能够较快的恢复，有的甚至未经特殊治疗，也能够恢复。
三、慢性心肌炎或者是心肌炎后扩张型心肌病，只急性或者是隐匿起病后，病情继续发展，出现心脏逐渐扩大或者是石壁瘤形成。心功能逐渐恶化或者是症状反复发作，最终会导致扩张性心肌病表现者。
病毒性心肌炎有很长的平台期，约有10%到20%的患者可以发展成为慢性的心肌炎，其中一小部分患者最后发展成为扩张性心肌病。一但进展为扩张型心肌病，一般患者在确诊两年后死亡，最有效的治疗是心脏移植。
